唇腭裂的预防关键在于怀孕早期，即妊娠头3个月左右是关键时期。孕妇要避免烟酒、病毒感染、污染等可能的致病因素，适当补充叶酸。还需要提醒的是，有的爱美女性会使用一些减肥、丰胸产品，长时间服用，这其中所含的激素也可能带来不良后果。
具体说来，目前得到公认的唇腭裂可能致病因素大概有以下几点：
遗传因素：在过往被临床诊疗患者中，只有少数的患者可查到家族性因素，为多基因遗传性疾病，再发的危险性相对较小。
若父母正常且第一位子女唇腭裂，生育第二位唇腭裂子女可能性为5%。若父母中有一位唇腭裂患者，生育唇腭裂子女的可能性为5%。若父母都是唇腭裂，生育第一位子女的可能性为25%。
环境因素：尤其在城市里，水、空气的污染对怀孕的女性来说都十分危险，还有病毒感染(如流感)、X射线、汽车尾气、微波等，都可造成遗传基因的突变等。
药物因素：母体怀孕期间患有如贫血、糠尿病、严重营养障碍等慢性疾病或服用某些药物，如镇静药、抗癫痫药及激素类药等。
烟酒因素：资料表明孕妇早期大量吸烟(包括被动吸烟)及酗酒，其子女唇腭裂的发生率比无烟酒嗜好的孕妇要高，明星王菲就是一个典型例子。当然，吸二手烟也一样有危害。
情绪因素：俗话说病由心生，母亲在怀孕期间一定要保持平和的心态，这无论是对预防唇腭裂还是其他疾病或多或少都有一定的帮助。
当然，如果生了唇腭裂畸形的小孩，也不要过于担心，看看大明星王菲的孩子就知道了，只要悉心呵护，经过及时序列治疗，孩子一样能健康成长。
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胚胎学者指出唇腭裂形成于妊娠期的前三个月，在胚胎发育的早期，唇、腭是由两侧组织往身体中线融合起来的，若不能正常融合，就会产生各种不同部位的裂缝，出现唇裂、腭裂、唇腭裂这3种问题。
唇裂：单纯嘴唇裂开，称为唇裂，俗称“兔唇”，也可为后天因素造成，如外伤。唇侧裂比较多见，侧裂是指在人中的一侧或双侧发生裂隙，可同时伴腭裂。
腭裂：有时仅口腔内腭部裂开而外部正常，则称为腭裂，俗称“狼咽”。轻者仅表现为软腭部的悬雍垂(俗称“小舌头”)裂开，严重者则表现为从软腭到硬腭的整个腭部的裂开。此时患儿的口鼻腔之间没有了正常人的口盖来封闭，就形成了所谓的“狼咽”。
另外，唇腭裂指既有唇部裂开又有腭部裂开。
