许多酵母种群分泌有毒副产物，引发一系列消化疾病，如肠道易感染症候群，慢性便秘或者腹泻。其中一种有毒副产物是一种酶，它使得酵母能够穿洞进入肠壁从而造成肠漏症候群。由酵母产生的毒物在肠子上钻孔穿透肠壁，渗透进入孩子的血流。最终，有毒物质可能是灼伤或者穿过血脑屏障，并且通过干扰流向大脑的营养物来损伤知觉，认知，语言或者行为。
另外一个造成孩子大脑饥饿的机理是肠子没有完全或者没有适当地吸收蛋白质营养。一个健康的消化系统能够把复杂的食物分解成身体细胞能够吸收和代谢的形式。正如先前指出的那样，许多自闭症孩子都有消化酪蛋白和谷蛋白的障碍。酪蛋白是奶蛋白，谷蛋白是麦子和相关谷物中的植物蛋白。蛋白质的基本机构是氨基酸，氨基酸的短链成为缩氨酸。在消化过程中，许多蛋白质被分解成单个脂肪酸，其他的作为稍大的链运输起来。当食入的蛋白质被部分消化时，剩下的就是较长链的缩氨酸。一些自闭症研究者已经出版了科技文章，论述吸收不良，消化不良，以及尿中的不寻常蛋白质和缩氨酸的相关发现。在许多自闭症孩子当中，无法消化的蛋白质和缩氨酸来自酪蛋白和谷蛋白，大豆也经常是一个来源。
许多缩氨酸链随着尿排出体外。然而，许多自闭症孩子有肠漏，超过容许界限的这类物质就进入血流。我们在第一章中论述过，当这类物质到达脑部的时候，会产生一种强度是吗啡数倍的仿鸦片效果，通常这些特别的缩氨酸被称为鸦片体。
Paul Shattock博士，来自英国Sunderland 大学健康科学院自闭症研究小组，说他的研究表明在自闭症孩子大脑中的鸦片体的数量分自闭症的严重程度之间存在粗略的相关性。这些自然的类似吗啡的物质好像毒害孩子并且扰乱他们的动机导向，情感，感知，反应，和他们大脑的正常发展。Paul Shattock博士说鸦片体过度刺激神经键并且割断了通向大脑的正常信号传输。
在一些孩子当中，肠子不能有效地消化谷蛋白和酪蛋白，其部分原因是消化酶偏低。这些损伤可能是后天的，但对某些孩子来说也可能是遗传的。对于
消化功能受损的孩子，一项治疗就是在食物中补充消化酶。然而，最近一项研究发现尽管消化酶有帮助作用，但是其效果只是相当于禁食含酪蛋白和谷蛋白食物的一半。Shattock博士通知我们一个两年的研究成果，就是许多自闭症孩子通过禁食获得了改善，当时重新吃奶类和麦类后又出现不同程度的倒退。
在我的医疗实践中，我已经看到了坚持禁食的自闭症患者取得的一些巨大进步。一个两岁的孩子通常也是挑食的。无论年龄如何，通常很困难在开始一个新的治疗方案时停止进食甜品。然而，为了遏制其负面效果，还是值得去做的。正如我不断重复的，现在我强烈建议每一个自闭症孩子的家长尝试全面给孩子至少禁食4到6个月含酪蛋白和谷蛋白的食物。在第五章，我将详细说明如何实现禁食。
