胚胎期肠管发育，在再管化过程中部分肠道终止发育造成肠腔完全或部分阻塞。完全阻塞为闭锁，部分阻塞则为狭窄。
辨症状 肛门疾病常见的症状有便血、肿痛、脱垂、流脓、便秘、分泌物等，由于病因不同，表现的症状及轻重程度也不一致。
1.便血 便血是内痔、肛裂、直肠息肉、直肠癌的共有症状。血不与大便相混，附于大便表面，或便时点滴而下，或一线如箭，血多而无疼痛者，多为内痔，便血少而有肛门疼痛者，多为肛裂。儿童便血，大便次数和性质无明显改变者，多为直肠息肉，血与粘液相混，其色晦暗，肛门有重坠感者，应考虑有直肠癌的可能。便血鲜红，血出如箭，并伴口渴，便秘，尿赤，舌红，脉数等症状，多属风热肠燥。便血色淡，伴有面色无华，心悸，神疲，乏力，舌淡，脉沉细等症状，属血虚肠燥。
2.肿痛 常见于肛旁脓肿、内痔嵌顿、外痔水肿、血栓外痔等病。肿胀高突，疼痛剧烈，多为湿热阻滞，可伴有胸闷腹胀，体倦身重，食欲不振，发热，苔黄腻，脉濡数等症状，常见于肛旁脓肿，外痔水肿。微肿微痛者，每因气血、气阴不足，又兼湿热下注之虚中挟实证，可伴发热不高，神疲乏力，头晕心悸，盗汗，便溏或干结，舌淡或红，苔黄或腻，脉濡细等症状，常为肛旁脓肿而症状不明显者或结核性肛周感染。
3.脱垂 是Ⅱ、Ⅲ期内痔，直肠息肉，直肠脱垂的常见症状。脱垂而不能自行回纳者，多因气虚血弱，中气下陷，无以摄纳，伴有面色无华，头晕眼花，心悸气短，自汗盗汗，舌淡，脉沉细弱等症状。内痔脱出，嵌于肛外，红肿疼痛，不易复位者，多为湿热下迫，若复因染毒，热毒熏灼则局部糜烂坏死，可伴有寒热烦渴，便干尿黄，舌红，苔黄或腻，脉弦数等症状。
4. 流脓 常见于肛旁脓肿或肛瘘。脓出黄稠带粪臭者，多为湿热蕴阻肛门，热盛肉腐而成脓，伴有发热，口苦，身重体倦，食欲不振，溲赤，苔黄或腻，脉弦或数等。脓出稀薄不臭，或微带粪臭，淋漓不尽，创口潜形，周围有空腔，不易敛合者，多为气阴两亏兼湿热下注之证，可伴低热盗汗，面色萎黄，神疲纳呆，舌淡红，脉濡细等。
5.便秘 是痔、肛裂、肛旁脓肿、肛管直肠癌的常见症状。腹满胀痛，拒按，大便秘结，伴口臭、心烦，身热溲赤，舌红，苔黄燥，脉数等，多属肠胃实热。腹满作胀，喜按而便不润者，多属血虚肠燥或脾虚不运，可伴面色苍白，头晕心悸，神疲乏力，舌淡，脉细无力等。
6. 分泌物 常见于内痔脱出、直肠脱垂、肛瘘等。多为湿热下注或热毒蕴结所致，常伴有局部肿痛，口干，纳呆，胸闷不舒，便溏或干结，溲赤，舌红，苔黄腻，脉弦数。内痔、直肠嵌顿坏死及实证肛瘘多见。分泌液清稀不臭，多为虚证脱肛、内痔脱垂或虚证肛瘘。
辨部位 以膀胱截石位表示，内痔好发于肛门齿线以上3、7、11点处，赘皮外痔多发生于6、12点处，环形的结缔组织性外痔多见于经产妇，血栓外痔好发于肛缘3、9点处;肛裂好发于6、12点处。肛瘘瘘管外口发生于3、9点前面的，其管道多为直行;发生于3、9点后面的，其管道往往弯曲，且其内口多在6点处附近;凡瘘管外口距肛缘近的，其管道也短(指通向肛内)，凡瘘管外口距肛缘较远的，则其管道也长;环肛而生的马蹄形肛瘘，其内口常在6点处附近。
