在便秘之中最常见的是习惯性便秘，也叫做弛缓性便秘，约占便秘人口的三分之二。这是因为肠子的蠕动运动迟钝所引起的。运动不足、水分不足、食物纤维摄取量过少的人，就会引起便秘。
总之，如果粪便在肠子内长时间残留，坏菌以此作为食物，不断繁殖，使得肠内变成坏菌的乐园。
这样一来，坏菌所制造的阿摩尼亚、胺、硫化氢等有害物质会被肠子渐渐吸收，这些物质会顺着血液而循环全身。便秘长久持续后会引起头痛、肩膀酸痛、肌肤粗糙等各种症状。
另外，坏菌也会制造出致癌物质，所以会诱发大肠癌等重大疾病。
乳酸菌对于消除习惯性便秘以及暂时性便秘非常有效。便秘的人，场内呈现碱性，这会使得肠子的功能变得迟钝。不过如果肠内的乳酸菌占优势时，乳酸菌所创造的‘酸’可以改变肠内的环境，将碱性转变为酸性。这会刺激到肠子，使大肠蠕动活泼，促进排便顺利进行。
