小儿慢性腹泻常导致营养不良，进而引起死亡。全世界每年约有500万儿童死于这种情况，成为儿童死亡的第一位原因。在我国北京地区小儿慢性腹泻主要由沙门氏菌引起，并同时伴有肠道功能失调。急性菌痢转为慢性菌痢者约占10%-15%，小儿慢性菌痢比成人少得多，急转慢者在1%以下，小儿患慢性腹泻时的诊疗方法是：
(1)首先要进行细菌培养及大便常规检查，弄清腹泻原因，有针对性地进行抗菌治疗。
(2)调整饮食。腹泻患儿，大部分有双糖酶水闰的下降。此时，如果禁食，可以减轻腹泻但饥饿更加重营养不良；如不控制饮食，必加重腹泻。此时需要有一个饮食调整阶段，给患儿以“特殊饮食”，我们称之为“饮食疗法”。对大部分病儿，效果十分明显。饮食的配制，主要采用脱脂奶、米汤及糕干粉。
(3)加强全身及肠道局部抵抗力，提高机体免疫功能。慢性腹泻患儿的肠粘膜与大便中免疫球蛋白A含量明显下降，是腹泻慢性化的原因。常采用胸腺肽等免疫调节剂，必要时输新鲜血，并注意补充钙、钾及各种微量元素。
