肺炎支原体进入宝宝体内后并不立即引起症状，在潜伏了约2～3周后才会引起症状。宝宝主要表现为发热、头痛、畏寒、咳嗽、疲乏、全身不适、食欲不振等。
初期宝宝咳嗽少痰，呈干咳状，以后逐渐转成顽固性的剧烈咳嗽，伴有少量黏液样痰，特别在夜间咳得很厉害，有点像百日咳。婴幼儿表现出喘憋和呼吸困难。其中约3%～10%可以发展成支原体肺炎。
有的患儿无明显的咳嗽，而以高热、寒战和咽痛症状为主。
肺炎支原体还会引起其他系统和器官的病变，如麻疹样皮疹、肌痛、游走性关节疼痛、肝功能损害、溶血性贫血、脑膜脑炎、心肌炎、心包炎、肾炎等。
中西医结合治疗效果好
正确选择抗菌素是治疗支原体肺炎成败的关键。由于支原体躲在细胞内，而青霉素类及头孢霉素类药物在细胞内浓度很低，加之这两种抗菌素是通过破坏细菌的细胞壁杀灭细菌的，而支原体没有细胞壁，使得以上两种抗菌素“无能为力”。临床应用证实红霉素在细胞内浓度很高，可以杀灭支原体，但是红霉素副作用较大，近年已用阿奇霉素代替，后者作用时间长，每天只需服用一次，副作用相对较少。一般需服用2～3周药物，否则容易复发。
在服用抗生素的同时应用中医中药疗效更好，因为中药治疗支原体感染不仅是针对支原体，还可调动机体的免疫功能，促进排痰，增强呼吸功能。常用炙麻黄、杏仁、生石膏、黄芩、射干、蝉衣、僵蚕、前胡、沙参等药物配合。
