智力落后的原因是由多方面因素造成的，至今仍有一部分尚未明确的因素，有待今后进一步的科学研究才能得知。
先天因素、妊期和产期的因素有：遗传因素、宫内感染因素、母体营养不良、母体疾病、母体受到不良理化因素的影响、分娩瞬间的致残因素、产伤、新生儿窒息、颅内出血、接生时的意外事故等等。
脑系统疾患也是重要的致残因素，新生儿化脓性脑膜炎、流行性乙型脑炎、结核性脑膜炎、脑积水、颅脑外伤等等。
社会心理因素也是智残原因之一，如近亲婚配、父母双方或一方低智力、低文化、吸毒饮酒、吸烟等。恶劣的生活环境和恶劣的教育条件等，都会使孩子智力落后。
社会环境中的不利因素，如各种毒物(铅、汞、砷等)中毒，地区性缺碘等。孕期营养不良及孩子出生后的严重营养不良。
