众所周知，脆弱的免疫系统（无论先天还是后天的）使得孩子在慢性感染面前没有抵抗能力。所以加拿大研究者发现自闭症发生几率跟耳朵感染之间关系密切一点也不意外。实际上，耳朵感染的高频度与自闭症的最严重形式彼此成正比。对自闭症类其他障碍的研究也得出同样的结论。例如，对ADHD儿童的研究发现儿童早期的耳朵感染频率与多动的程度成正比。
尽管对大多数人来说感染可能不是自闭症或者ADHD 的首要原因，但是感染构成了整个病症发展的第一步，因为中耳炎通常被认为有感染性的细菌类病源，而且细菌感染一般使用抗生素来对治。滑稽的是，大规模的以聚合酶为基础的研究证实约35%的耳朵感染并非源自细菌。进一步说，尽管二次世界大战以后抗生素已经挽救了数以百万计的生命，但是大多数医生开抗生素的处方太轻率了。抗生素滥用的一个后果就是无数细菌正对抗生素形成抵抗力。另外一个后果是这种神奇药物把肠道内的保护性细菌连同病菌一同杀死。毁坏肠道有益菌群值得我们深刻关注。这个破坏作用为真菌和细菌的过度生长打开了大门。在许多个案中，孩子的慢性腹泻或便秘可能就是酵母菌过度生长的一个症状。
有害细菌和真菌在肠道内的繁殖会造成什么样的后果呢？著名研究者和临床试验室主任William Shaw博士曾撰文写道：自闭症流行的原因是因为滥用抗生素之后身体吸收了来自肠道的酵母菌和抗药细菌所产生的异常副产品。我当然同意细菌和真菌过渡生长造成很多孩子的疾病升级直到形成自闭症或其他同类障碍。
当我们健康时，假丝酵母要么跟有益菌群和潜在有害细菌的混合物处于不稳定平衡下，要么处于停战状态。像梭菌这样的细菌一样，假丝酵母能够在没有氧气的情况下通过转化成无氧真菌的形式继续生存。大多数抗生素只能杀死呼吸氧气的细菌。假丝酵母能够在抗生素的攻击下安然无恙，也能在肠道细菌突然全部消失的情况下像野火般扩散。不管什么原因，只要婴儿或幼儿已经有了一个虚弱的免疫系统，接下来的菌群繁殖，无论是真菌还是病菌，都对肠子健康不利。
